TRPC7 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRPC7, TRP7, transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 |
---|
Зовнішні ІД | MGI: 1349470 HomoloGene: 22689 GeneCards: TRPC7 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
2-aminoethoxydiphenylborate, амілорид[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • store-operated calcium channel activity • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium channel activity • inositol 1,4,5 trisphosphate binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • nuclear envelope • мембрана • cis-Golgi network • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • cation channel complex |
---|
Біологічний процес | • regulation of cytosolic calcium ion concentration • ion transport • single fertilization • platelet activation • calcium ion transmembrane transport • manganese ion transport • calcium ion transport • трансмембранний транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/0e/PBB_GE_TRPC7_208589_at_fs.png/250px-PBB_GE_TRPC7_208589_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001167576 NM_001167577 NM_020389 NM_001376901 |
| | NM_012035 NM_001302372 NM_001302373 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001161048 NP_001161049 NP_065122 NP_001363830 |
| | NP_001289301 NP_001289302 NP_036165 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 136.21 – 136.37 Mb | Хр. 13: 56.92 – 57.04 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRPC7 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily C member 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 862 амінокислот, а молекулярна маса — 99 562[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLRNSTFKNM | | QRRHTTLREK | | GRRQAIRGPA | | YMFNEKGTSL | | TPEEERFLDS |
AEYGNIPVVR | | KMLEESKTLN | | FNCVDYMGQN | | ALQLAVGNEH | | LEVTELLLKK |
ENLARVGDAL | | LLAISKGYVR | | IVEAILNHPA | | FAQGQRLTLS | | PLEQELRDDD |
FYAYDEDGTR | | FSHDITPIIL | | AAHCQEYEIV | | HILLLKGARI | | ERPHDYFCKC |
NECTEKQRKD | | SFSHSRSRMN | | AYKGLASAAY | | LSLSSEDPVL | | TALELSNELA |
RLANIETEFK | | NDYRKLSMQC | | KDFVVGVLDL | | CRDTEEVEAI | | LNGDVNFQVW |
SDHHRPSLSR | | IKLAIKYEVK | | KFVAHPNCQQ | | QLLTMWYENL | | SGLRQQSIAV |
KFLAVFGVSI | | GLPFLAIAYW | | IAPCSKLGRT | | LRSPFMKFVA | | HAVSFTIFLG |
LLVVNASDRF | | EGVKTLPNET | | FTDYPKQIFR | | VKTTQFSWTE | | MLIMKWVLGM |
IWSECKEIWE | | EGPREYVLHL | | WNLLDFGMLS | | IFVASFTARF | | MAFLKATEAQ |
LYVDQHVQDD | | TLHNVSLPPE | | VAYFTYARDK | | WWPSDPQIIS | | EGLYAIAVVL |
SFSRIAYILP | | ANESFGPLQI | | SLGRTVKDIF | | KFMVIFIMVF | | VAFMIGMFNL |
YSYYRGAKYN | | PAFTTVEESF | | KTLFWSIFGL | | SEVISVVLKY | | DHKFIENIGY |
VLYGVYNVTM | | VVVLLNMLIA | | MINNSYQEIE | | EDADVEWKFA | | RAKLWLSYFD |
EGRTLPAPFN | | LVPSPKSFYY | | LIMRIKMCLI | | KLCKSKAKSC | | ENDLEMGMLN |
SKFKKTRYQA | | GMRNSENLTA | | NNTLSKPTRY | | QKIMKRLIKR | | YVLKAQVDRE |
NDEVNEGELK | | EIKQDISSLR | | YELLEEKSQA | | TGELADLIQQ | | LSEKFGKNLN |
KDHLRVNKGK | | DI |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lussier M.P., Lepage P.K., Bousquet S.M., Boulay G. (2008). RNF24, a new TRPC interacting protein, causes the intracellular retention of TRPC. Cell Calcium. 43: 432—443. PMID 17850865 DOI:10.1016/j.ceca.2007.07.009
- Yuasa K., Matsuda T., Tsuji A. (2011). Functional regulation of transient receptor potential canonical 7 by cGMP-dependent protein kinase Ialpha. Cell. Signal. 23: 1179—1187. PMID 21402151 DOI:10.1016/j.cellsig.2011.03.005
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20754 (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9HCX4 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|