TRPM1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRPM1, CSNB1C, LTRPC1, MLSN1, transient receptor potential cation channel subfamily M member 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603576 MGI: 1330305 HomoloGene: 19940 GeneCards: TRPM1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
congenital stationary night blindness 1C[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
pregnenolone sulfate[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium channel activity • ion channel activity • cation channel activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • new growing cell tip |
---|
Біологічний процес | • G protein-coupled glutamate receptor signaling pathway • calcium ion transport into cytosol • відповідь на стимул • ion transport • protein tetramerization • calcium ion transmembrane transport • retinal rod cell development • cellular response to light stimulus • зір • GO:0072468 сигнальна трансдукція • ion transmembrane transport • трансмембранний транспорт • cation transmembrane transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/5a/PBB_GE_TRPM1_206479_at_fs.png/250px-PBB_GE_TRPM1_206479_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000274965 ENSG00000134160 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001252020 NM_001252024 NM_001252030 NM_002420 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001238949 NP_001238953 NP_001238959 NP_002411 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 31 – 31.16 Mb | Хр. 7: 63.8 – 63.92 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRPM1 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 603 амінокислот, а молекулярна маса — 182 178[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKDSNRCCCG | | QFTNQHIPPL | | PSATPSKNEE | | ESKQVETQPE | | KWSVAKHTQS |
YPTDSYGVLE | | FQGGGYSNKA | | MYIRVSYDTK | | PDSLLHLMVK | | DWQLELPKLL |
ISVHGGLQNF | | EMQPKLKQVF | | GKGLIKAAMT | | TGAWIFTGGV | | STGVISHVGD |
ALKDHSSKSR | | GRVCAIGIAP | | WGIVENKEDL | | VGKDVTRVYQ | | TMSNPLSKLS |
VLNNSHTHFI | | LADNGTLGKY | | GAEVKLRRLL | | EKHISLQKIN | | TRLGQGVPLV |
GLVVEGGPNV | | VSIVLEYLQE | | EPPIPVVICD | | GSGRASDILS | | FAHKYCEEGG |
IINESLREQL | | LVTIQKTFNY | | NKAQSHQLFA | | IIMECMKKKE | | LVTVFRMGSE |
GQQDIEMAIL | | TALLKGTNVS | | APDQLSLALA | | WNRVDIARSQ | | IFVFGPHWPP |
LGSLAPPTDS | | KATEKEKKPP | | MATTKGGRGK | | GKGKKKGKVK | | EEVEEETDPR |
KIELLNWVNA | | LEQAMLDALV | | LDRVDFVKLL | | IENGVNMQHF | | LTIPRLEELY |
NTRLGPPNTL | | HLLVRDVKKS | | NLPPDYHISL | | IDIGLVLEYL | | MGGAYRCNYT |
RKNFRTLYNN | | LFGPKRPKAL | | KLLGMEDDEP | | PAKGKKKKKK | | KKEEEIDIDV |
DDPAVSRFQY | | PFHELMVWAV | | LMKRQKMAVF | | LWQRGEESMA | | KALVACKLYK |
AMAHESSESD | | LVDDISQDLD | | NNSKDFGQLA | | LELLDQSYKH | | DEQIAMKLLT |
YELKNWSNST | | CLKLAVAAKH | | RDFIAHTCSQ | | MLLTDMWMGR | | LRMRKNPGLK |
VIMGILLPPT | | ILFLEFRTYD | | DFSYQTSKEN | | EDGKEKEEEN | | TDANADAGSR |
KGDEENEHKK | | QRSIPIGTKI | | CEFYNAPIVK | | FWFYTISYLG | | YLLLFNYVIL |
VRMDGWPSLQ | | EWIVISYIVS | | LALEKIREIL | | MSEPGKLSQK | | IKVWLQEYWN |
ITDLVAISTF | | MIGAILRLQN | | QPYMGYGRVI | | YCVDIIFWYI | | RVLDIFGVNK |
YLGPYVMMIG | | KMMIDMLYFV | | VIMLVVLMSF | | GVARQAILHP | | EEKPSWKLAR |
NIFYMPYWMI | | YGEVFADQID | | LYAMEINPPC | | GENLYDEEGK | | RLPPCIPGAW |
LTPALMACYL | | LVANILLVNL | | LIAVFNNTFF | | EVKSISNQVW | | KFQRYQLIMT |
FHDRPVLPPP | | MIILSHIYII | | IMRLSGRCRK | | KREGDQEERD | | RGLKLFLSDE |
ELKRLHEFEE | | QCVQEHFREK | | EDEQQSSSDE | | RIRVTSERVE | | NMSMRLEEIN |
ERETFMKTSL | | QTVDLRLAQL | | EELSNRMVNA | | LENLAGIDRS | | DLIQARSRAS |
SECEATYLLR | | QSSINSADGY | | SLYRYHFNGE | | ELLFEDTSLS | | TSPGTGVRKK |
TCSFRIKEEK | | DVKTHLVPEC | | QNSLHLSLGT | | STSATPDGSH | | LAVDDLKNAE |
ESKLGPDIGI | | SKEDDERQTD | | SKKEETISPS | | LNKTDVIHGQ | | DKSDVQNTQL |
TVETTNIEGT | | ISYPLEETKI | | TRYFPDETIN | | ACKTMKSRSF | | VYSRGRKLVG |
GVNQDVEYSS | | ITDQQLTTEW | | QCQVQKITRS | | HSTDIPYIVS | | EAAVQAEHKE |
QFADMQDEHH | | VAEAIPRIPR | | LSLTITDRNG | | MENLLSVKPD | | QTLGFPSLRS |
KSLHGHPRNV | | KSIQGKLDRS | | GHASSVSSLV | | IVSGMTAEEK | | KVKKEKASTE |
TEC |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Fang D., Setaluri V. (2000). Expression and up-regulation of alternatively spliced transcripts of melastatin, a melanoma metastasis-related gene, in human melanoma cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 279: 53—61. PMID 11112417 DOI:10.1006/bbrc.2000.3894
- Xu X.-Z.S., Moebius F., Gill D.L., Montell C. (2001). Regulation of melastatin, a TRP-related protein, through interaction with a cytoplasmic isoform. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 10692—10697. PMID 11535825 DOI:10.1073/pnas.191360198
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRPM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7146 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q7Z4N2 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|