TPCN1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TPCN1, TPC1, two pore segment channel 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609666 MGI: 2182472 HomoloGene: 9905 GeneCards: TPCN1 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
phosphatidyl (3,5) inositol biphosphate, верапаміл[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium channel activity • voltage-gated ion channel activity • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • NAADP-sensitive calcium-release channel activity • voltage-gated calcium channel activity • calcium activated cation channel activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • ендосома • мембрана • клітинна мембрана • lysosomal membrane • лізосома • endosome membrane • CatSper complex |
---|
Біологічний процес | • membrane depolarization during action potential • positive regulation of autophagy • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • ion transmembrane transport • calcium ion transmembrane transport • calcium ion transport • трансмембранний транспорт • release of sequestered calcium ion into cytosol • flagellated sperm motility |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001143819 NM_001301214 NM_017901 NM_001351346 NM_001351347 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001137291 NP_001288143 NP_060371 NP_001338275 NP_001338276 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 113.22 – 113.3 Mb | Хр. 5: 120.67 – 120.73 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TPCN1 (англ. Two pore segment channel 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 816 амінокислот, а молекулярна маса — 94 147[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAVSLDDDVP | | LILTLDEGGS | | APLAPSNGLG | | QEELPSKNGG | | SYAIHDSQAP |
SLSSGGESSP | | SSPAHNWEMN | | YQEAAIYLQE | | GENNDKFFTH | | PKDAKALAAY |
LFAHNHLFYL | | MELATALLLL | | LLSLCEAPAV | | PALRLGIYVH | | ATLELFALMV |
VVFELCMKLR | | WLGLHTFIRH | | KRTMVKTSVL | | VVQFVEAIVV | | LVRQMSHVRV |
TRALRCIFLV | | DCRYCGGVRR | | NLRQIFQSLP | | PFMDILLLLL | | FFMIIFAILG |
FYLFSPNPSD | | PYFSTLENSI | | VSLFVLLTTA | | NFPDVMMPSY | | SRNPWSCVFF |
IVYLSIELYF | | IMNLLLAVVF | | DTFNDIEKRK | | FKSLLLHKRT | | AIQHAYRLLI |
SQRRPAGISY | | RQFEGLMRFY | | KPRMSARERY | | LTFKALNQNN | | TPLLSLKDFY |
DIYEVAALKW | | KAKKNREHWF | | DELPRTALLI | | FKGINILVKS | | KAFQYFMYLV |
VAVNGVWILV | | ETFMLKGGNF | | FSKHVPWSYL | | VFLTIYGVEL | | FLKVAGLGPV |
EYLSSGWNLF | | DFSVTVFAFL | | GLLALALNME | | PFYFIVVLRP | | LQLLRLFKLK |
ERYRNVLDTM | | FELLPRMASL | | GLTLLIFYYS | | FAIVGMEFFC | | GIVFPNCCNT |
STVADAYRWR | | NHTVGNRTVV | | EEGYYYLNNF | | DNILNSFVTL | | FELTVVNNWY |
IIMEGVTSQT | | SHWSRLYFMT | | FYIVTMVVMT | | IIVAFILEAF | | VFRMNYSRKN |
QDSEVDGGIT | | LEKEISKEEL | | VAVLELYREA | | RGASSDVTRL | | LETLSQMERY |
QQHSMVFLGR | | RSRTKSDLSL | | KMYQEEIQEW | | YEEHAREQEQ | | QRQLSSSAAP |
AAQQPPGSRQ | | RSQTVT |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані, лізосомі, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Two pore segment channel 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18182 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9ULQ1 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|