TPCN2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TPCN2, SHEP10, TPC2, two pore segment channel 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 612163 MGI: 2385297 HomoloGene: 16375 GeneCards: TPCN2 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
phosphatidyl (3,5) inositol biphosphate, верапаміл[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium channel activity • voltage-gated ion channel activity • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • protein kinase binding • NAADP-sensitive calcium-release channel activity • voltage-gated calcium channel activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • endosome membrane • лізосома • lysosomal membrane |
---|
Біологічний процес | • release of sequestered calcium ion into cytosol • membrane depolarization during action potential • response to vitamin D • regulation of ion transmembrane transport • cellular calcium ion homeostasis • ion transport • ion transmembrane transport • regulation of autophagy • calcium ion transmembrane transport • lysosome organization • calcium-mediated signaling • calcium ion transport • трансмембранний транспорт • smooth muscle contraction |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 69.05 – 69.14 Mb | Хр. 7: 144.74 – 144.84 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TPCN2 (англ. Two pore segment channel 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 752 амінокислот, а молекулярна маса — 85 243[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAEPQAESEP | | LLGGARGGGG | | DWPAGLTTYR | | SIQVGPGAAA | | RWDLCIDQAV |
VFIEDAIQYR | | SINHRVDASS | | MWLYRRYYSN | | VCQRTLSFTI | | FLILFLAFIE |
TPSSLTSTAD | | VRYRAAPWEP | | PCGLTESVEV | | LCLLVFAADL | | SVKGYLFGWA |
HFQKNLWLLG | | YLVVLVVSLV | | DWTVSLSLVC | | HEPLRIRRLL | | RPFFLLQNSS |
MMKKTLKCIR | | WSLPEMASVG | | LLLAIHLCLF | | TMFGMLLFAG | | GKQDDGQDRE |
RLTYFQNLPE | | SLTSLLVLLT | | TANNPDVMIP | | AYSKNRAYAI | | FFIVFTVIGS |
LFLMNLLTAI | | IYSQFRGYLM | | KSLQTSLFRR | | RLGTRAAFEV | | LSSMVGEGGA |
FPQAVGVKPQ | | NLLQVLQKVQ | | LDSSHKQAMM | | EKVRSYGSVL | | LSAEEFQKLF |
NELDRSVVKE | | HPPRPEYQSP | | FLQSAQFLFG | | HYYFDYLGNL | | IALANLVSIC |
VFLVLDADVL | | PAERDDFILG | | ILNCVFIVYY | | LLEMLLKVFA | | LGLRGYLSYP |
SNVFDGLLTV | | VLLVLEISTL | | AVYRLPHPGW | | RPEMVGLLSL | | WDMTRMLNML |
IVFRFLRIIP | | SMKLMAVVAS | | TVLGLVQNMR | | AFGGILVVVY | | YVFAIIGINL |
FRGVIVALPG | | NSSLAPANGS | | APCGSFEQLE | | YWANNFDDFA | | AALVTLWNLM |
VVNNWQVFLD | | AYRRYSGPWS | | KIYFVLWWLV | | SSVIWVNLFL | | ALILENFLHK |
WDPRSHLQPL | | AGTPEATYQM | | TVELLFRDIL | | EEPGEDELTE | | RLSQHPHLWL |
CR |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані, лізосомі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lam A.K., Galione A., Lai F.A., Zissimopoulos S. (2013). Hax-1 identified as a two-pore channel (TPC)-binding protein. FEBS Lett. 587: 3782—3786. PMID 24188827 DOI:10.1016/j.febslet.2013.10.031
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Two pore segment channel 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20820 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8NHX9 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|