CLCA1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CLCA1, CACC, CACC1, CLCRG1, CaCC-1, GOB5, hhCaCC-1, chloride channel accessory 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603906 MGI: 1346342 HomoloGene: 984 GeneCards: CLCA1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • chloride channel activity • metallopeptidase activity • metalloendopeptidase activity • intracellular calcium activated chloride channel activity |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • Мікроворсинки • zymogen granule membrane • мембрана • клітинна мембрана • secretory granule • міжклітинний простір |
---|
Біологічний процес | • calcium ion transport • протеоліз • chloride transport • ion transport • ion transmembrane transport • cellular response to hypoxia • chloride transmembrane transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/11/PBB_GE_CLCA1_210107_at_fs.png/250px-PBB_GE_CLCA1_210107_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 86.47 – 86.5 Mb | Хр. 3: 144.71 – 144.74 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CLCA1 (англ. Chloride channel accessory 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 914 амінокислот, а молекулярна маса — 100 226[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGPFKSSVFI | | LILHLLEGAL | | SNSLIQLNNN | | GYEGIVVAID | | PNVPEDETLI |
QQIKDMVTQA | | SLYLLEATGK | | RFYFKNVAIL | | IPETWKTKAD | | YVRPKLETYK |
NADVLVAEST | | PPGNDEPYTE | | QMGNCGEKGE | | RIHLTPDFIA | | GKKLAEYGPQ |
GRAFVHEWAH | | LRWGVFDEYN | | NDEKFYLSNG | | RIQAVRCSAG | | ITGTNVVKKC |
QGGSCYTKRC | | TFNKVTGLYE | | KGCEFVLQSR | | QTEKASIMFA | | QHVDSIVEFC |
TEQNHNKEAP | | NKQNQKCNLR | | STWEVIRDSE | | DFKKTTPMTT | | QPPNPTFSLL |
QIGQRIVCLV | | LDKSGSMATG | | NRLNRLNQAG | | QLFLLQTVEL | | GSWVGMVTFD |
SAAHVQNELI | | QINSGSDRDT | | LAKRLPAAAS | | GGTSICSGLR | | SAFTVIRKKY |
PTDGSEIVLL | | TDGEDNTISG | | CFNEVKQSGA | | IIHTVALGPS | | AAQELEELSK |
MTGGLQTYAS | | DQVQNNGLID | | AFGALSSGNG | | AVSQRSIQLE | | SKGLTLQNSQ |
WMNGTVIVDS | | TVGKDTLFLI | | TWTMQPPQIL | | LWDPSGQKQG | | GFVVDKNTKM |
AYLQIPGIAK | | VGTWKYSLQA | | SSQTLTLTVT | | SRASNATLPP | | ITVTSKTNKD |
TSKFPSPLVV | | YANIRQGASP | | ILRASVTALI | | ESVNGKTVTL | | ELLDNGAGAD |
ATKDDGVYSR | | YFTTYDTNGR | | YSVKVRALGG | | VNAARRRVIP | | QQSGALYIPG |
WIENDEIQWN | | PPRPEINKDD | | VQHKQVCFSR | | TSSGGSFVAS | | DVPNAPIPDL |
FPPGQITDLK | | AEIHGGSLIN | | LTWTAPGDDY | | DHGTAHKYII | | RISTSILDLR |
DKFNESLQVN | | TTALIPKEAN | | SEEVFLFKPE | | NITFENGTDL | | FIAIQAVDKV |
DLKSEISNIA | | RVSLFIPPQT | | PPETPSPDET | | SAPCPNIHIN | | STIPGIHILK |
IMWKWIGELQ | | LSIA |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію, хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Agnel M., Vermat T., Culouscou J.-M. (1999). Identification of three novel members of the calcium-dependent chloride channel (CaCC) family predominantly expressed in the digestive tract and trachea. FEBS Lett. 455: 295—301. PMID 10437792 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00891-1
- Bustin S.A., Li S.-R., Dorudi S. (2001). Expression of the Ca2+-activated chloride channel genes CLCA1 and CLCA2 is downregulated in human colorectal cancer. DNA Cell Biol. 20: 331—338. PMID 11445004 DOI:10.1089/10445490152122442
- Toda M., Tulic M.K., Levitt R.C., Hamid Q. (2002). A calcium-activated chloride channel (HCLCA1) is strongly related to IL-9 expression and mucus production in bronchial epithelium of patients with asthma. J. Allergy Clin. Immunol. 109: 246—250. PMID 11842292 DOI:10.1067/mai.2002.121555
- Thai P., Chen Y., Dolganov G., Wu R. (2005). Differential regulation of MUC5AC/Muc5ac and hCLCA-1/mGob-5 expression in airway epithelium. Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 33: 523—530. PMID 16151054 DOI:10.1165/rcmb.2004-0220RC
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2015 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
- ↑ UniProt, A8K7I4 (англ.) . Архів оригіналу за 14 січня 2018. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|