SCN4B |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4MZ2, 4MZ3 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SCN4B, ATFB17, LQT10, Navbeta4, sodium voltage-gated channel beta subunit 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608256 MGI: 2687406 HomoloGene: 18384 GeneCards: SCN4B |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
long QT syndrome 10[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • sodium channel regulator activity • transmembrane transporter binding • sodium channel activity • voltage-gated ion channel activity • voltage-gated sodium channel activity involved in cardiac muscle cell action potential • voltage-gated sodium channel activity |
---|
Клітинна компонента | • voltage-gated sodium channel complex • integral component of membrane • мембрана • intercalated disc • intrinsic component of plasma membrane • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • cardiac muscle contraction • sodium ion transmembrane transport • sodium ion transport • regulation of ion transmembrane transport • cardiac muscle cell action potential involved in contraction • ion transport • regulation of sodium ion transmembrane transporter activity • GO:0061423 positive regulation of sodium ion transport • AV node cell action potential • regulation of heart rate by cardiac conduction • membrane depolarization during cardiac muscle cell action potential • regulation of ventricular cardiac muscle cell membrane repolarization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001142348 NM_001142349 NM_174934 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001135820 NP_001135821 NP_777594 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 118.13 – 118.15 Mb | Хр. 9: 45.05 – 45.07 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SCN4B (англ. Sodium voltage-gated channel beta subunit 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 228 амінокислот, а молекулярна маса — 24 969[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPGAGDGGKA | | PARWLGTGLL | | GLFLLPVTLS | | LEVSVGKATD | | IYAVNGTEIL |
LPCTFSSCFG | | FEDLHFRWTY | | NSSDAFKILI | | EGTVKNEKSD | | PKVTLKDDDR |
ITLVGSTKEK | | MNNISIVLRD | | LEFSDTGKYT | | CHVKNPKENN | | LQHHATIFLQ |
VVDRLEEVDN | | TVTLIILAVV | | GGVIGLLILI | | LLIKKLIIFI | | LKKTREKKKE |
CLVSSSGNDN | | TENGLPGSKA | | EEKPPSKV |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт натрію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном натрію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Gilchrist J., Das S., Van Petegem F., Bosmans F. (2013). Crystallographic insights into sodium-channel modulation by the beta4 subunit. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 110: E5016—E5024. PMID 24297919 DOI:10.1073/pnas.1314557110
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SCN4B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10592 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8IWT1 (англ.) . Архів оригіналу за 23 листопада 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|